جداسازی و آنالیز فیلوژنتیکی یک جدایه ویروس پیچیدگی برگ شلغم از گیاه تاتوره

Authors

Abstract:

ویروس پیچیدگی برگ شلغم (Turnip curly top virus,TCTV) به­ عنوان ویروس تیپ جنس Turncurtovirus از خانواده Geminiviridae چند سال قبل از ایران گزارش گردید. این ویروس دارای دامنه میزبانی وسیعی در میان سبزیجات و علف‌های هرز است. در این پژوهش، آلودگی گیاه تاتوره (Datura stramonium L.) با علائم زردی عمومی، پیچیدگی شدید و فنجانی شدن برگ‌ها با استفاده از آزمون پی سی آر، به TCTV اثبات گردید. سپس طول کامل ژنوم ویروس با تلفیق پی سی آر و روش تکثیر دایره غلتان (rolling circle amplification, RCA) و استفاده از یک جفت آغازگر همپوشان تکثیر و بعد از همسانه‌سازی، در ناقل pJET1.2 تعیین ترادف گردید و ترادف بدست آمده به لحاظ فیلوژنتیکی مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. نتایج بدست آمده بیانگر آن است که جدایه تاتوره دارای بیشترین و کمترین میزان شباهت (بترتیب 2/99 و 8/85 درصد) با جدایه‌های همین ویروس می‌باشد که پیشتر بترتیب از گیاهان شلغم و ترب گزارش شده‌اند. به رغم مشابهت بالای ترادف نوکلئوتیدی ژنوم جدایه تاتوره با جدایه شلغم، پروتئین rep رمزشده توسط جدایه تاتوره در انتهای N-terminal دارای 14 اسیدآمینه بیشتر است. در میان نژادهای پنج گانه TCTV، جدایه تاتوره متعلق به نژاد C بوده و در کنار جدایه‌هائی قرار می‌گیرند که قبلا از گیاه شلغم یا از بدن زنجرک‌ها گزارش شده است. نتایج این تحقیق، بار دیگر دامنه میزبانی وسیع تِرنکِرتوویروس‌ها در علف‌های هرز و نقش آن­ها را در آلودگی سبزیجات تائید می‌کند.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

انتقال و میزبان‌های طبیعی ویروس پیچیدگی برگ شلغم

ویروس پیچیدگی برگ شلغم (Turnip curly top virus, TCTV) یک جمینی ویروس جدید است که اخیراً از مزارع شلغم استان فارس گزارش شده است. از آنجا که این ویروس از نظر سازمان‌دهی ژنوم از سایر جمینی ویروس‌ها متفاوت است، هنوز بسیاری از ویژگی‌های بیولوژیکی آن از جمله ناقل و سایر میزبان‌های طبیعی آن مورد مطالعه قرار نگرفته است. به منظور شناسایی ناقل TCTV در شرایط آزمایشگاهی، توانایی زنجرک‌های Circulifer hae...

full text

انتقال و میزبان های طبیعی ویروس پیچیدگی برگ شلغم

ویروس پیچیدگی برگ شلغم (turnip curly top virus, tctv) یک جمینی ویروس جدید است که اخیراً از مزارع شلغم استان فارس گزارش شده است. از آنجا که این ویروس از نظر سازمان­دهی ژنوم از سایر جمینی ویروس­ها متفاوت است، هنوز بسیاری از ویژگی­های بیولوژیکی آن از جمله ناقل و سایر میزبان­های طبیعی آن مورد مطالعه قرار نگرفته است. به منظور شناسایی ناقل tctv در شرایط آزمایشگاهی، توانایی زنجرک­های circulifer haemato...

full text

تحلیل فیلوژنتیکی دو جدایه ایرانی ویروس موزائیک شلغم (tumv) و آنالیز پروتئوم گیاه آلوده به این ویروس با استفاده از الکتروفورز دوبعدی

تعداد 436 نمونه مشکوک به آلودگی ویروسی در طول ماه های اسفند 89 و فروردین 90 از مزارع کلزا جمع‎آوری و با آزمون الایزا و آنتی سرم‎های اختصاصی tumv، tcv و tymv مورد سنجش قرار گرفت که از میان آن ها 117 نمونه به tumv و هفت نمونه به tcv آلودگی داشتند. خالص سازی بیولوژیکی یکی از نمونه‏های آلوده (جدایه گوارشک) انجام شد و پس از استخراج rnaی کل گیاه، ژن پوشش پروتئینی ویروس با آزمون rt-pcr تکثیر (bp 986) ...

ساخت سازه عفونت زا و تعیین میزبان های طبیعی ویروس پیچیدگی برگ شلغم

ویروس پیچیدگی برگ شلغم (turnip curly top virus, tctv)، جمینی ویروسی جدید با ویژگی های منحصر به فرد است که در سال 1389 از مناطق ظفرآباد و همایجان واقع در استان فارس گزارش شده است. این ویروس از لحاظ نحوه ی سازماندهی ژنوم و جایگاه فیلوژنتیکی کاملا متفاوت از سایر جمینی ویروس ها است و بطور موقت در جنس curtovirus قرار داده شده است. علیرغم متمایز بودن، هنوز قدرت بیماریزایی ژنوم تک بخشی tctv به اثبات ن...

15 صفحه اول

همسانه سازی و بیان ژن پروتئین نوترکیب ویروس پیچیدگی برگ شلغم (tctv) در باکتری escherichia coli

چکیده ویروس پیچیدگی برگ شلغم ( turnip curly top virus, tctv) یک جمینی ویروسی جدید با ویژگی های منحصر به فرد است که در سال 1389 از ایران (فارس) گزارش شده است. مطالعه ویژگی های بیولوژیکی این ویروس، مستلزم برقراری یک روش ردیابی ویروس در طبیعت است. بدلیل کارائی بهتر روش های سرولوژیکی در شناسایی ویروس های گیاهی، در تحقیق حاضر اقدام به فراهم سازی بستری جهت تولید آنتی بادی و به تبع آن، ردیابی این ویر...

بررسی خصوصیات بیولوژیکی و فیلوژنتیکی ویروس موزائیک کلم‌گل (Cauliflower mosaic virus) از گیاه کلزا در ایران

ویروس موزائیک کلم‌گل (CaMV) یکی از ویروس‌های مهم آلوده‌کننده و خسارت‌زا در گیاهان تیره Brassicaceae از جمله کلزا (Brassica napus L.) است. جهت ردیابی CaMV در گیاه کلزا، در مجموع 684 عدد از نمونه‌های برگی دارای علائم ویروسی از مزارع کلزای استان‌های تهران،  قزوین، چهارمحال و بختیاری، مازندران، اردبیل، آذربایجان غربی و فارس جمع‌آوری شد. نمونه‌ها با روش سرولوژیک DAS-ELISA با آنتی س...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 54  issue 2

pages  77- 85

publication date 2018-07-23

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023